SnapGene最新版是一款專業(yè)優(yōu)秀的分子生物學(xué)軟件。SnapGene官方版功能多樣，涵蓋可視化、模擬、避免錯(cuò)誤、自動(dòng)記錄、擁有您的數(shù)據(jù)、轉(zhuǎn)換文件格式等特點(diǎn)。通過SnapGene軟件用戶可以優(yōu)化改善你的策略，快速創(chuàng)建質(zhì)粒圖譜，幫助用戶模擬各種常見的克隆和PCR方法。 相似軟件版本說明軟件地址nds模擬器2.6a 最新版查看云機(jī)管家0.9.8 電腦版查看win7家庭版中文版查看小白一鍵重裝系統(tǒng)12.6.48.1920 電腦版查看快捷啟動(dòng)管理工具4.02 最新版查看

SnapGene功能介紹

1、成對(duì)對(duì)齊

可以通過局部，全局或半全局比對(duì)來分析成對(duì)的DNA或蛋白質(zhì)序列。

2、從Ensembl導(dǎo)入

現(xiàn)在可以將來自Ensembl基因組瀏覽器的基因或轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)直接導(dǎo)入SnapGene。

3、定向TOPO ®克隆

一個(gè)新的界面會(huì)模擬定向TOPO ®克隆到拓?fù)洚悩?gòu)酶活化載體。

4、靈活地對(duì)準(zhǔn)參考

與參考DNA序列比對(duì)的界面已得到增強(qiáng)。各種顯示選項(xiàng)的控件更加直觀，并且可以將比對(duì)限制在參考序列的指定鏈或區(qū)域內(nèi)。

5、可拖動(dòng)的不對(duì)齊端

對(duì)于已與參考DNA序列部分比對(duì)的序列，現(xiàn)在可以將未比對(duì)的末端部分拖出并可視化。

6、Anza?酶

Thermo Fisher(Invitrogen)的Anza?酶系統(tǒng)已合并到SnapGene的酶數(shù)據(jù)庫中。

7、可自定義的背景色

可以更改SnapGene接口的背景顏色。

8、要素類型的可見性控件

可以根據(jù)要素類型顯示或隱藏要素。

9、氨基酸的新選擇

可以將翻譯特征中的氨基酸設(shè)置為小寫，并且可以以3個(gè)字母的格式復(fù)制一段氨基酸。

10、密碼子頻率計(jì)算器

可以為一個(gè)或多個(gè)翻譯特征生成密碼子頻率表。

11、DNA到蛋白質(zhì)的比對(duì)轉(zhuǎn)換

可以翻譯DNA比對(duì)的選定區(qū)域以產(chǎn)生相應(yīng)的蛋白質(zhì)比對(duì)。

12、比對(duì)cDNA的內(nèi)含子注釋

當(dāng)cDNA與參考基因組DNA序列比對(duì)時(shí)，該cDNA可用于創(chuàng)建一個(gè)特征，其中的缺口被注釋為內(nèi)含子。

13、地圖中的擴(kuò)展選擇端點(diǎn)

現(xiàn)在，選擇項(xiàng)用加長(zhǎng)線標(biāo)記，這可以闡明選擇端點(diǎn)，還可以增強(qiáng)小選擇項(xiàng)的可見性。

14、DNASIS文件導(dǎo)入器

SnapGene現(xiàn)在可以識(shí)別傳統(tǒng)DNASIS程序中的文件。

SnapGene軟件特色

1、看看你在想什么

確切地查看正在做什么，從而簡(jiǎn)化克隆。

2、看看你在想什么

確切地查看正在做什么，從而簡(jiǎn)化克隆。

3、瞬間模擬

輕松計(jì)劃克隆，并以您認(rèn)為的最快速度進(jìn)行仿真。

4、準(zhǔn)確克隆

通過在計(jì)劃錯(cuò)誤發(fā)生之前及時(shí)發(fā)現(xiàn)它們，防止浪費(fèi)和沮喪。

5、保留完整記錄

自動(dòng)生成每個(gè)序列編輯和克隆過程的豐富圖形歷史記錄。

6、擁有您的數(shù)據(jù)

完全控制序列的存儲(chǔ)位置。

7、轉(zhuǎn)換和共享數(shù)據(jù)

從常見文件格式導(dǎo)入序列和注釋。

SnapGene軟件優(yōu)勢(shì)

一、想象

1、DNA可視化

查看DNA序列的多個(gè)視圖。

地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史

自定義酶位點(diǎn)，特征，引物，ORF，DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。

使用雙鏈模式查看酶位點(diǎn)，具有翻譯，引物和DNA顏色的特征。單鏈模式顯示具有彩色特征的緊湊概覽。

從一系列酶組中選擇。剪切網(wǎng)站可以顯示為數(shù)字或行，按名稱或頻率排序。

按名稱，位置，大小，顏色，方向性或類型對(duì)帶注釋的要素列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

按名稱，長(zhǎng)度，顏色，結(jié)合位點(diǎn)，方向性或解鏈溫度對(duì)雜交引物列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

查看DNA構(gòu)建體的自動(dòng)生成的圖形歷史記錄。祖先序列可以作為單獨(dú)的文件恢復(fù)

2、大序列支持

瀏覽染色體大小序列。

查看 · 搜索 · 縮放

利用SnapGene的高效數(shù)據(jù)處理功能，掃描具有數(shù)千種注釋功能的大型DNA序列。

使用專有的MICA算法立即在染色體內(nèi)找到序列。

使用多功能控件調(diào)整縮放系數(shù)和顯示區(qū)域。

3、蛋白質(zhì)可視化

查看蛋白質(zhì)序列的多個(gè)視圖。

地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史

自定義區(qū)域，站點(diǎn)，鍵和序列顏色的顯示。

使用具有相關(guān)特征的1-或3個(gè)字母的氨基酸代碼查看蛋白質(zhì)序列。

查看蛋白質(zhì)的分子量，消光系數(shù)，等電點(diǎn)和氨基酸組成?？梢詫?duì)蛋白質(zhì)的選定部分進(jìn)行相同的分析。

按名稱，位置，大小，顏色或類型對(duì)帶注釋的功能列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

查看自動(dòng)生成的蛋白質(zhì)序列圖形歷史記錄。祖先蛋白質(zhì)或DNA序列可以作為單獨(dú)的文件再生。

4、直觀的序列編輯

輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。

標(biāo)準(zhǔn)編輯 · DNA結(jié)束

進(jìn)行插入，刪除，替換和大小寫更改。復(fù)制并粘貼序列時(shí)，會(huì)自動(dòng)傳輸功能。

編輯線性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。

5、序列顏色編碼

將選定的DNA或氨基酸序列設(shè)置為十種顏色之一。

給兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見。

6、特征注釋

自動(dòng)注釋常用功能，或手動(dòng)注釋新功能。

自動(dòng)特征檢測(cè) · 手動(dòng)特征注釋

使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫查找DNA序列中的常見特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫中。

選擇DNA或蛋白質(zhì)序列的一部分，并使用靈活的GenBank兼容控件注釋特征。

二、模擬

1、限制性站點(diǎn)指標(biāo)

確認(rèn)限制性網(wǎng)站適合克隆。

獨(dú)特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性質(zhì)

以粗體顯示獨(dú)特的限制性位點(diǎn)，或選擇自動(dòng)定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

不要被愚弄，因?yàn)橄拗菩晕稽c(diǎn)被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動(dòng)用星號(hào)標(biāo)記該站點(diǎn)。

利用工具提示來避免有問題的限制網(wǎng)站。

2、限制性克隆

可視化克隆過程的所有方面。

如果您已經(jīng)考慮過程，則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過程存在設(shè)計(jì)缺陷，則可以捕獲并糾正錯(cuò)誤。

3、PCR

模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR。

使用您自己的引物，或要求SnapGene自動(dòng)設(shè)計(jì)引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲(chǔ)模板和引物。

4、重疊延伸PCR

通過重疊延伸PCR融合片段

最多可組裝八個(gè)碎片。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。

5、引物定向誘變

使用誘變引物進(jìn)行定點(diǎn)誘變。

選擇誘變引物，按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。

6、網(wǎng)關(guān)®克隆

模擬網(wǎng)關(guān)® BP克隆或LR克隆，或兩者在同一時(shí)間。

為方便起見，提供了常見的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。

7、吉布森大會(huì)®

通過融合多達(dá)八個(gè)片段或通過將多達(dá)八個(gè)片段插入向量來模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無縫克隆方法。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

8、IN-FUSION ®克隆

通過在向量中插入最多八個(gè)片段來模擬Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一種非常通用的方法，可用于創(chuàng)建無縫基因融合。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

9、TA和GC克隆

通過TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物。

選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效GC克隆。

為方便起見，提供了常見的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

10、退火Oligos

退火兩個(gè)寡核苷酸形成雙鏈產(chǎn)物。

使用簡(jiǎn)單的控件添加突出限制克隆。

三、避免錯(cuò)誤

使用SnapGene，確保構(gòu)造符合您的要求，并確認(rèn)您獲得了所需的序列。

1、閱讀基因融合的框架

確保構(gòu)造中的已轉(zhuǎn)換要素符合框架。

鏈接翻譯 · 警告信息

使用“序列”視圖可以快速查看兩個(gè)已翻譯的要素是否在框架中。如果是這樣，翻譯鏈接在同一行。如果不是，則翻譯在單獨(dú)的行上。

2、與參考序列對(duì)齊

使用強(qiáng)大的對(duì)齊工具檢查實(shí)際構(gòu)造是否與模擬構(gòu)造匹配。

地圖概述 · 序列詳細(xì)信息

請(qǐng)參閱對(duì)齊序列與參考序列匹配的位置的概述，以及存在差異的位置。

四、自動(dòng)錄制

SnapGene自動(dòng)記錄操作以創(chuàng)建圖形歷史記錄，并將祖先結(jié)構(gòu)存儲(chǔ)在最終文件中。

1、全面的“撤銷”能力

幾乎撤消任何操作。

不要害怕嘗試使用SnapGene文件 - 回溯您的步驟很容易。

2、歷史和嵌入式祖先

查看構(gòu)造的圖形歷史記錄。

單擊操作以突出顯示親本和產(chǎn)物序列的相關(guān)部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

單擊歷史記錄樹中的祖先以重新生成該祖先序列文件，包括其注釋和克隆歷史記錄。

3、歷史色彩

使用可選的歷史記錄顏色來標(biāo)識(shí)序列的最新更改。

詳細(xì)了解構(gòu)建體的組裝方式，包括結(jié)扎的粘性末端。

五、擁有你的數(shù)據(jù)

SnapGene允許您根據(jù)需要閱讀和共享文件，同時(shí)保持對(duì)數(shù)據(jù)的完全控制。

1、安全文件管理

將SnapGene文件保存在所需的位置。

使用熟悉的安全操作系統(tǒng)來存儲(chǔ)和整理SnapGene文件。

2、從其他格式導(dǎo)入

閱讀許多常見的文件格式。

不僅可以導(dǎo)入DNA序列，還可以導(dǎo)入注釋和注釋。我們將繼續(xù)開發(fā)進(jìn)口商，以確保您不會(huì)被鎖定為專有文件格式。

3、導(dǎo)出為標(biāo)準(zhǔn)格式

將序列，地圖或凝膠圖像轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)格式，以便與其他軟件一起使用。

將序列導(dǎo)出為GenBank或FASTA格式。將地圖或模擬瓊脂糖凝膠導(dǎo)出為常見的圖像格式。

4、使用SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)

將SnapGene格式的文件發(fā)送給可以下載免費(fèi)SnapGene Viewer的同事或客戶。

只需將文件與鏈接一起發(fā)送到SnapGene Viewer即可。收件人將能夠看到地圖，序列和注釋，就像在完整的SnapGene界面中一樣。

5、對(duì)于開發(fā)人員

要將SnapGene整合到您的數(shù)據(jù)分析或?qū)嶒?yàn)室管理軟件中，請(qǐng)聯(lián)系我們以獲取有關(guān)如何讀取和寫入SnapGene文件的信息。

六、轉(zhuǎn)換文件格式

開放式信息交換至關(guān)重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了讀取和導(dǎo)出常見文件格式的選項(xiàng)。

從其他格式導(dǎo)入時(shí)，目標(biāo)不僅是捕獲DNA序列，還捕獲注釋和注釋

SnapGene安裝步驟

1.在本站下載SnapGene最新版安裝包，解壓后，雙擊“exe”文件

2.進(jìn)行安裝向?qū)?，點(diǎn)擊“Browse”選擇安裝位置，一般默認(rèn)在C盤，推薦安裝在D盤，單擊Next

3.閱讀許可協(xié)議，單擊I Agree

4.選擇想要安裝的組件，單擊Next

5.軟件信息已準(zhǔn)備就緒，單擊Install安裝

6.軟件正在安裝，請(qǐng)耐心等待

7.SnapGene安裝完成，單擊Finish，退出安裝向?qū)?

SnapGene更新日志

1.細(xì)節(jié)更出眾!

2.BUG去無蹤